„FoundationOne“ krūties vėžio mėginiuose nustatytas kliniškai reikšmingas pažaidas gali susieti su  naujomis taikinių terapijos rūšimis ir klinikiniais tyrimais. Šie duomenys gali padėti gydytojui suplanuoti paciento gydymą .1,9

Iki šiol „FoundationOne“ metodu buvo nustatyta daugiau kaip 11 000 krūties vėžio profilių. Šie duomenys nuolat kaupiami išsamioje „Foundation Medicine“ genomo duomenų bazėje – „FoundationCORE“.6

__

Klinikinė „FoundationOne“ reikšmė, sergant krūties vėžiu

Įrodyta, kad „FoundationOne“ metodu galima nustatyti genomo pažeidimus, sergant recidyvavusiu ir metastazavusiu krūties vėžiu, kurie nebūtų nustatyti kitais metodais, pavyzdžiui FISH arba IHC.9

„FoundationOne“ metodu galima „trigubai neigiamo“ krūties vėžio mėginiuose nustatyti įvairias vedančias praktinės reikšmės turinčias mutacijas, taigi didėja išsamaus krūties vėžio genominio profilio tyrimo svarba.21 Žinodami inicijuojančias krūties vėžio mutacijas, gydytojai gali parinkti tinkamą gydymą.

Patobulėjus genominio profilio tyrimams, galima nustatyti daugiau krūties vėžio gydymo taikinių, negu taikant įprastinius diagnostikos metodus.9,22 Pavyzdžiui, viename tyrime, kuriame 100 krūties vėžio audinių buvo ištirta nuadojant viso egzono sekoskaitą, buvo surastos devynios naujos pažaidos.22  Nustačius papildomas genų pažaidas, padidėja taikinių terapijos pasirinkimo įvairovė, ir gydymą galima pritaikyti konkrečiam ligoniui.

Somatinių mutacijų dažnis žmogaus krūties navikų genome (vėžio genomo atlaso duomenimis)23

[Grafikas – iš  Eralp Y. „Translational Oncogenomics“ 2016:8(S1) 1–7 doi: 10.4137/TOG.S39410.]23

 

__

„FoundationOne“ dėka krūties vėžiu sergantiems pacientams gali būti pasiūlyta daugiau gydymo variantų

 „FoundationOne“ gali nustatyti genų pakitimus, kurie atsiranda sergant įvairiais vėžio tipais ir kurių galima nepastebėti tiriant kitais įprastais metodais. Naudojant šį tyrimo metodą, nustatomi gydymo taikiniai – prasiplečia efektyvios terapijos ribos.2,18,24,25 „FoundationOne“ tinka visų krūties vėžio tipų profilio tyrimams, tarp jų ir šeiminiam, uždegiminiam, lobuliniam ir „trigubai neigiamam“ krūties vėžiui tirti. 1,9,26 „FoundationOne“ gali būti naudingas, nustatant genų pažaidas, kai yra IV stadijos (metastazavęs) krūties vėžys ir ypač tuomet, kai diagnozuojamas paveldimas su BRCA1 ir BRCA2 mutacijomis susijęs krūties vėžys.9,26,27

Didėjant žinomų vėžinių genų skaičiui, daugėja taikinių, kuriuose gali veikti specifinė taikinių terapija, tuo pačiu mažėja reikšmė tų tyrimų, kurie ieško iš anksto žinomų pavienių mutacijų, pavyzdžiui, „karšto taško“ sekoskaitos.5,8,10,11 Kad būtų galima pasirinkti tinkamiausią taikinį gydymui, reikia labai tikslaus diagnostinio testo, kuris galėtų nustatyti visas kliniškai reikšmingas genų pažaidas.5,8

Ar „FoundationOne“ tinka visų vėžio tipų tyrimui?

„FoundationOne“ tinka visų solidinių navikų tyrimams, tarp jų ir retiems bei nežinomos kilmės vėžiniams susirgimams, recidyvavusiems arba metastazavusiems solidiniams vėžiams, tirti.1,7„FoundationOne“ tinka visų krūties vėžio tipų profilio tyrimams, tarp jų ir šeiminiam, uždegiminiam, lobuliniam ir „trigubai neigiamam“ krūties vėžiui tirti. 9,26,27

Šis tyrimo metodas gali būti ypač naudingas, kai reikia pasirinkti tarp daugelio gydymo variantų arba atvirkščiai, kai gydymo variantų beveik nėra, arba, kai nustatomos nebūdingos arba retos solidinių navikų genominės pažaidos, kurių lengva nepastebėti atliekant įprastinius tyrimus. 1,7

„FoundationOne“ tinka visų solidinių navikų tyrimams, tarp jų ir retiems bei nežinomos kilmės vėžiniams susirgimams, recidyvavusiems arba metastazavusiems solidiniams vėžiams, tirti.1,7„FoundationOne“ tinka visų krūties vėžio tipų profilio tyrimams, tarp jų ir šeiminiam, uždegiminiam, lobuliniam ir „trigubai neigiamam“ krūties vėžiui tirti. 9,26,27

Šis tyrimo metodas gali būti ypač naudingas, kai reikia pasirinkti tarp daugelio gydymo variantų arba atvirkščiai, kai gydymo variantų beveik nėra, arba, kai nustatomos nebūdingos arba retos solidinių navikų genominės pažaidos, kurių lengva nepastebėti atliekant įprastinius tyrimus. 1,7

Literatūra
  1. FoundationOne technical information.
  2. Rozenblum AB et al. J Thorac Oncol 2017; 2:258–268 (and supplementary material).
  3. Chalmers ZR et al. Genome Med 2017; 9:34.
  4. Genomeweb. Foundation Medicine Q3 revenues up 45 percent. Available at: https://www.genomeweb.com/molecular-diagnostics/foundation-medicine-q3-revenues-45-percent [accessed November 2017].
  5. Frampton, GM et al. Nat Biotechnol 2013; 31:1023–1031
  6. Foundation Medicine. FoundationCORE press release, June 2016.
  7. Schwaederle M et al. Mol Cancer Ther 2015; 14:1488–1494.
  8. Drilon A et al. Clin Cancer Res 2015; 16:3631–3639.
  9. Ross JS et al. Cancer 2016; 17:2654–2562.
  10. Hirsch FR et al. Lancet 2016; 388:1012–1024.
  11. Aitken M et al. Global Oncology Trend Report 2015. Available at: http://keionline.org/sites/default/files/IIHI_Oncology_Trend_Report_2015.pdf (accessed November 2017).
  12. Kos Z and Dabbs DJ. Histopathology 2016; 68:70–85.
  13. Bishop R. Bioscience Horizons 2010; 1:85–95.
  14. Chen AY-Y and Chen A. J Invest Dermatol 2013; 133:e8.
  15. Angulo B et al. PLoS One 2012; 8:e43842.
  16. Pao W and Girard N. Lancet Oncol 2011; 12:175–180.
  17. Jordan EJ et al. Cancer Discov 2017; 6:596–609.
  18. Ali SM et al. Oncologist 2016; 6:762–670.
  19. Suh JH et al. The Oncologist 2016; 21:684–691.
  20. National Comprehensive Cancer Network (NCCN) NSCLC guidelines, Version 9, 2017.
  21. Dillon JL et al. The Breast 2016; 29:202–207.
  22. Stephens PJ et al. Nature 2012; 7403:400–404.
  23. Eralp Y. Tranl Oncogenomics 2016; 8:1–7.
  24. Schrock AB et al. Clin Cancer Res 2016; 13:3281–3215.
  25. Chmielecki J et al. Oncologist 2015; 20:7–12.
  26. Yuan Y et al. Oncotarget 2012: doi: 10.18632/oncotarget.14476.
  27. Roche Foundation Medicine data on file.
  28. Masucci GV et al. Int J Immunother Cancer Res 2016; 4:16.
  29. National Cancer Institute (NIH). NCI dictionary of cancer terms. Available at: https://www.cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-terms?cdrid=285933 [accessed November 2017].
  30. Sinicrope FA. Nat Rev Clin Oncol 2010; 7:174–177.
  31. The Cancer Genome Atlas Network, Nature 2012; 487:330–337.